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    Métodos moleculares para la determinación del genotipo del virus de la hepatitis C

    Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica 2007;25(Supl.3): 66-71

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    NAVARRO ORTEGA D, JIMÉNEZ MAYORDOMO M, MARTÍNEZ APARICIO MD

    Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica 2007;25(Supl.3): 66-71

    Tipo artículo: Revisión

    Resumen del Autor: Se han descrito 6 genotipos y hasta 80 subtipos del virus de la hepatitis C (VHC). El conocimiento del genotipo infectante es crucial para tratar adecuadamente al paciente. El método de referencia para la tipificación molecular del VHC es la secuenciación completa del genoma viral y su posterior análisis filogenético. Sin embargo, esta posibilidad no está al alcance de la mayoría de los laboratorios hospitalarios. Existen varios métodos alternativos comercializados; los de uso más extendido se basan en el análisis de la región 5?UTR mediante amplificación y posterior secuenciación directa (TRUGENE 5?NC Genotyping Kit; Visible Genetics, Toronto, Ontario, Canadá) o hibridación inversa de los amplicones con sondas dispuestas en línea sobre membrana-LiPA- (INNO-LiPA HCV I/II/ VERSANT HCV Genotype Assay 1.0; Innogenetics, N.V., Zwijnaarde, Bayer Healthcare, Bélgica). Los resultados obtenidos con estos ensayos son generalmente superponibles; identifican correctamente los genotipos en un 95-100% (clasifican algunos genotipos 4 y 6 como genotipos 1), pero su índice de acierto es menor (70-85%) con los subtipos, particularmente 1a,1b, 2a/2c y 4a/4c. Existe una nueva generación de pruebas comercializadas con mejores prestaciones: GEN-ETI-K DEIA kit (Sorin, Saluggia, Italy) que analiza la región core; TRUGENE NS5B Genotyping Assay (Bayer Healhcare, Bélgica), la región NS5B; Real Time HCV Genotyping Test (Abbott, MS) las regiones 5?UTR y la NS5B y VERSANT 2.0 (Bayer), las regiones 5?UTR y core; estos ensayos son muy certeros en la determinación del genotipo y de la mayoría de subtipos conflictivos, particularmente 1a y 1b.

    Notas:

     

    Palabras clave:

    ID MEDES: 37036



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